蜂蜜對一般人來說都是沒有問題的，除了有些特殊情況與特定人群要特別注意：
1、忌早上空腹飲用
早上喝水有利於機體排毒和補水，因此很多人喜歡早上起床後喝一杯蜂蜜水，事實上早上空腹飲用蜂蜜水不但起不到排毒的功效，而且不能有效地補充機體細胞的水分，同時長期空腹喝蜂蜜水易使體內酸性增加，時間長了會胃酸過多而得胃潰瘍或十二指腸潰瘍，所以早上飲用蜂蜜水前應先喝一杯溫開水。
2、忌開水沖泡蜂蜜
蜂蜜中含有的酶類尤其是淀僂酶對熱極不穩定，不合理的加熱會使蜂蜜中的營養物質被嚴重破壞，導致酶類失活、顏色變深、香味揮發、滋味改變，甚至可能導致沖泡出的蜂蜜水有怪酸味，因此蜂蜜最好使用60℃以下(最好用40℃)的溫開水或涼開水沖泡，在沖泡時注意一定不要用開水，更不將蜂蜜進行煎煮。
3、忌喝後立即入睡
晚上喝蜂蜜有鎮靜安眠的功效，但喝完蜂蜜水馬上睡則健康不利，飲用蜂蜜水後血液的粘稠度會升高，使血液流動速度降低，從而達不到鎮靜安眠的效果，且蜂蜜水含有的糖分也極容易轉換成脂肪堆積在身體里而導致發胖，另外如果喝完蜂蜜水後沒有漱口或刷牙，對牙齒和口腔衛生也非常不利。
4、忌長期過量飲用
蜂蜜正常飲用對身體有保健作用，正常成人每天食用蜂蜜約80-100克左右為宜，長期過量飲用對健康是非常不利的，因為蜂蜜中的葡萄糖和果糖可直接被人體吸收入血，一次進食蜂蜜量大就可使血糖快速上升，長時間“過量”飲用蜂蜜水會導致胰島素分泌不足而易引發糖尿病。
5、忌飯後立刻飲用
飯後立刻飲用蜂蜜水會稀釋胃液，使食物還沒來得及完全消化就進入小腸，從而不利食物消化，而且食物遇到水容易膨脹，對胃部造成更大壓力，因此長期飯後飲用蜂蜜水會增加腸胃病風險，正確的飲用方法是飯後1小時再飲用，對於腸胃功能不好的人群來說要再推遲半小時再飲用蜂蜜水。
< 喝蜂蜜水的禁忌人群>
1、糖尿病患者
糖尿病患者喝蜂蜜要謹慎，原因是蜂蜜中含有大量的葡萄糖和果糖等單醣，這些單醣可不經胃腸消化而直接進入血液中，因此糖尿病患者在血糖尚未得到控制時喝蜂蜜會引起血糖異常升高，但若糖尿病患者的血糖已得到控制時則可在醫生的指導下適量喝些蜂蜜。
2、肝硬化患者
肝硬化患者不能喝蜂蜜，原因是肝硬化時肝細胞已遭到嚴重破壞且肝功能也差，若再喝富含單醣的蜂蜜則反而加重肝臟纖維化，但肝炎或肝功能不良等人群喝蜂蜜則有保肝作用，原因是蜂蜜中富含的營養物質能增強肝臟解毒功能並能促進肝細胞再生和自我修復。
3、高血糖人群
高血糖人群喝蜂蜜要謹慎，原因是蜂蜜的主要成分是單醣且單醣含量可高達70%以上，喝蜂蜜後這些單醣可不經消化便直接進入血液中，也就是說蜂蜜有極為顯著的升糖效果，因此高血糖人群喝蜂蜜時一定要謹慎，尤其是長期過量食用甚至可能誘發糖尿病等問題。
4、痛風患者
痛風患者不能喝蜂蜜，原因是蜂蜜中含有大量的果糖(葡萄糖的同分異構體)，有些蜜蜂果糖含量甚至高達40%以上，這些果糖不但導致體內尿酸生成量增多，而且還會因胰島素抵抗而間接減少尿酸排泄，也就是說果糖攝入過量是誘發痛風及高尿酸血症的重要原因。如果想吃蜂蜜，可以選擇葡萄含量高過果糖比例的蜂蜜種類，比如荔枝蜜。
5、一歲內嬰兒
一歲內嬰兒不能喝蜂蜜，原因是蜜蜂在採集花蜜時難免會採到有毒植物，同時蜂蜜在釀製和採收過程中又難免被有毒病菌污染，這些有毒成分對胃腸功能已健全的成年人而言雖然是微不足道的，但對於胃腸功能尚不健全的周歲內嬰兒來說則可能會引發食物中毒。